Om LBU eller FBU är valt går det att ange kostnad för bankavgift under kolumnen Avg. Bankavgifter bokförs automatiskt mot ett annat konto än betalningstransaktionens konto. Ett speciellt standardkonto under Systemvård | Tabeller | Kontoplan / Standardkonton finns för detta ändamål. Standardkontot heter Balanskonto bankavgifter. Det finns möjlighet att boka bankavgifter mot samma konto som betalningen. Systeminställningen Bankavgift bokförs på samma konto som betalning på fliken Inköp i Systeminställningar ger denna möjlighet.